Sara fête son anniversaire avec des amis dans le Manoir Burkitt, réputé hanté. En effet, les forces du mal ont été réveillées et des présences non désirées vont s'inviter à la fête...
Alvin et les Chipmunks ont leur propre attraction au parc Majestic Movie Studios. Un soir, ils manquent la fermeture et se retrouvent enfermés. Le Dr. Frankenstein qui possède lui aussi son attraction découvre la présence des petites bêtes et se met à leur recherche...
Enfermé avec sa fille dans la Bibliothèque de New York, coupée du monde, un radiologue découvre qu'il a été sélectionné pour réprésenter et défendre l'Humanité contre 7 races d'aliens.